Passive radar parallel processing using General-Purpose computing on Graphics Processing Units

In the paper an implementation of signal processing chain for a passive radar is presented. The passive radar which was developed at the Warsaw University of Technology, uses FM radio and DVB-T television transmitters as "illuminators of opportunity". As the computational load associated with passive radar processing is very high, NVIDIA CUDA technology has been employed for effective implementation using parallel processing. The paper contains the description of the algorithms implementation and the performance results analysis

Association of germline genetic variants in RFC, IL15 and VDR genes with minimal residual disease in pediatric B-cell precursor ALL

Minimal residual disease (MRD) enables reliable assessment of risk in acute lymphoblastic leukemia (ALL). However, little is known on association between MRD status and germline genetic variation. We examined 159 Caucasian (Slavic) patients with pediatric ALL, treated according to ALL-IC-BFM 2002/2009 protocols, in search for association between 23 germline polymorphisms and MRD status at day 15, day 33 and week 12, with adjustment for MRD-associated clinical covariates. Three variants were significantly associated with MRD: rs1544410 in VDR (MRD-day15); rs1051266 in RFC (MRD-day33, MRD-week12), independently and in an additive effect with rs10519613 in IL15 (MRD-day33). The risk alleles for MRD-positivity were: A allele of VDR (OR = 2.37, 95%CI = 1.07–5.21, P = 0.03, MRD-day15); A of RFC (OR = 1.93, 95%CI = 1.05–3.52, P = 0.03, MRD-day33 and MRD-week12, P < 0.01); A of IL15 (OR = 2.30, 95%CI = 1.02–5.18, P = 0.04, MRD-day33). The risk for MRD-day33-positive status was higher in patients with risk alleles in both RFC and IL15 loci than in patients with risk alleles in one locus or no risk alleles: 2 vs. 1 (OR = 3.94, 95% CI = 1.28–12.11, P = 0.024), 2 vs. 0 (OR = 6.75, 95% CI = 1.61–28.39, P = 0.012). Germline variation in genes related to pharmacokinetics/pharmacodynamics of anti-leukemic drugs and to anti-tumor immunity of the host is associated with MRD status and might help improve risk assessment in ALL

Security theory and practice: Stablisation and reconstrution of post-conlict areas in the 21st century

Wprowadzenie: Cieszymy się, że możemy skierować do Państwa rąk kolejny numer periodyku „Bezpieczeństwo.Teoria i Praktyka”, tym razem poświęcony problematyce stabilizacji i odbudowy obszarów pokonfliktowych w XXI w. Podjęty temat jest niezwykle ważny, ponieważ żyjemy w czasach nieuporządkowanego świata, w którym liczba konfliktów zbrojnych o różnej skali i charakterze oraz wynikające z nich konsekwencje wpływają destrukcyjnie na ład międzynarodowy.Umiędzynarodowienie konfliktów wewnętrznych pełni często funkcję instrumentalną w grze, której stawką jest zajęcie przez dane państwo właściwego – z punktu widzenia jego decydentów – miejsca w nowym systemie ról międzynarodowych. Przykładem tego jest wojna domowa w Syrii, którą Jerzy Zdanowski w artykule rozpoczynającym tom traktuje jako „wojnę zastępczą”. Krótko przedstawia także istotę rekonstrukcji obszarów pokonfliktowych, czym jako badacz rozwija myśli pułkownika Piotra Gąstała, wieloletniego żołnierza i dowódcy Jednostki Wojskowej GROM, który podczas swojej służby przebywał w niejednym państwie dotkniętym konfliktem zbrojnym i wojną oraz ich skutkami. W udzielonym wywiadzie odnosi się on do zagadnienia stabilizacji ze swojej perspektywy – praktyka, któremu nie raz, na terenie prowadzenia działań wojskowych, przyszło mierzyć się z tym wszystkim, co kryje się pod tym pojęciem. Należy przy tym uwzględnić, że jako żołnierz jednostki specjalnej wykonywał tam specyficzne działania. O tym, jak podchodzą do nich nie tylko praktycy, ale i badacze, pisze Piotr Orłowski, analizując znaczenie sił specjalnych jako narzędzia stabilizacji na obszarach pokonfliktowych

Ground truth based comparison of saliency maps algorithms

Abstract Deep neural networks (DNNs) have achieved outstanding results in domains such as image processing, computer vision, natural language processing and bioinformatics. In recent years, many methods have been proposed that can provide a visual explanation of decision made by such classifiers. Saliency maps are probably the most popular. However, it is still unclear how to properly interpret saliency maps for a given image and which techniques perform most accurately. This paper presents a methodology to practically evaluate the real effectiveness of saliency map generation methods. We used three state-of-the-art network architectures along with specially prepared benchmark datasets, and we proposed a novel metric to provide a quantitative comparison of the methods. The comparison identified the most reliable techniques and the solutions which usually failed in our tests

Polymorphic variants of MIF gene and prognosis in steroid therapy in children with idiopathic nephrotic syndrome

Nephrotic syndrome (NS) is the most common reason of proteinuria in children and can be caused by the pathology of renal glomeruli. Steroid therapy is typically used in this disorder. It has been shown that MIF is a cytokine which counteracts the immunosuppressive properties of glucocorticoids. The aim of this study was looking for a correlation between MIF polymorphisms and genetic susceptibility to steroid resistance in children with INS (Idiopathic NS). Methods: The study was performed in 71 patients with INS including SRNS (steroid resistance nephrotic syndrome) (41) and SSNS (steroid sensitive nephrotic syndrome) (30) and in 30 control subjects. We employed Sanger sequencing and capillary electrophoresis. Linkage disequilibrium was made using Haploview and PHASE. Results: We didn't observe a statistical significance between SNPs detected in patients with INS and controls. Our studies revealed statistical significance for two polymorphisms: rs2070767C > T and rs2000466T > G between patients with SRNS and SSNS. The results for rs34383331T > A are close to being statistically significant. Statistical significance was revealed for CATT5/CATT6 genotype in SRNS group vs SSNS group (OR=4.604, 95%CI=1.356-15.632, p=0.0168). We found that the frequency of 5/X-CATT genotype compared with X/X-CATT genotype was significantly higher in SRNS patients vs SSNS (OR=3.167, 95%CI=1.046-9.585, p=0.0426). In linkage disequilibrium analysis we didn't show involvement in susceptibility to INS and steroid sensitive phenotype. Conclusions: Our results suggest that the role of MIF polymorphisms in the susceptibility to positive response to steroid therapy is still unresolved. It indicates that MIF may be involved in indirect and complex molecular mechanisms of steroid activity in hormone-dependent metabolic pathways in children with INS. Because of ambiguous findings, pleiotropic features of this cytokine require that more research should be undertaken

Impact of Porcine Pancreas Decellularization Conditions on the Quality of Obtained dECM

Due to the limited number of organ donors, 3D printing of organs is a promising technique. Tissue engineering is increasingly using xenogeneic material for this purpose. This study was aimed at assessing the safety of decellularized porcine pancreas, together with the analysis of the risk of an undesirable immune response. We tested eight variants of the decellularization process. We determined the following impacts: rinsing agents (PBS/NH3·H2O), temperature conditions (4 °C/24 °C), and the grinding method of native material (ground/cut). To assess the quality of the extracellular matrix after the completed decellularization process, analyses of the following were performed: DNA concentration, fat content, microscopic evaluation, proteolysis, material cytotoxicity, and most importantly, the Triton X-100 content. Our analyses showed that we obtained a product with an extremely low detergent content with negligible residual DNA content. The obtained results confirmed the performed histological and immuno-fluorescence staining. Moreover, the TEM microscopic analysis proved that the correct collagen structure was preserved after the decellularization process. Based on the obtained results, we chose the most favorable variant in terms of quality and biology. The method we chose is an effective and safe method that gives a chance for the development of transplant and regenerative medicine

Impact of Porcine Pancreas Decellularization Conditions on the Quality of Obtained dECM

Due to the limited number of organ donors, 3D printing of organs is a promising technique. Tissue engineering is increasingly using xenogeneic material for this purpose. This study was aimed at assessing the safety of decellularized porcine pancreas, together with the analysis of the risk of an undesirable immune response. We tested eight variants of the decellularization process. We determined the following impacts: rinsing agents (PBS/NH3·H2O), temperature conditions (4 °C/24 °C), and the grinding method of native material (ground/cut). To assess the quality of the extracellular matrix after the completed decellularization process, analyses of the following were performed: DNA concentration, fat content, microscopic evaluation, proteolysis, material cytotoxicity, and most importantly, the Triton X-100 content. Our analyses showed that we obtained a product with an extremely low detergent content with negligible residual DNA content. The obtained results confirmed the performed histological and immuno-fluorescence staining. Moreover, the TEM microscopic analysis proved that the correct collagen structure was preserved after the decellularization process. Based on the obtained results, we chose the most favorable variant in terms of quality and biology. The method we chose is an effective and safe method that gives a chance for the development of transplant and regenerative medicine

Wytyczne postępowania diagnostyczno-terapeutycznego w raku wątrobowokomórkowym

Rak wątrobowokomórkowy jest najczęstszym pierwotnym nowotworem wątroby. Częstość występowania raka wątrobowokomórkowego zwiększała się na świecie w ciągu ostatnich dekad. W Polsce rak wątrobowo komórkowy jest rozpoznawany u około 1500 chorych rocznie. Rokowanie chorych na raka wątrobowokomórkowego jest nadal niezadowalające. Chorobie można zapobiegać w znacznym stopniu przez skuteczniejszą kontrolę czynników ryzyka oraz nadzór nad osobami z marskością wątroby. Właściwe postępowanie diagnostyczne i terapeutyczne może poprawić rokowanie chorych na raka wątrobowokomórkowego. Przedstawiamy aktualizowaną wersję wytycznych postępowania u osob z czynnikami ryzyka oraz rozpoznaniem raka wątrobowokomórkowego. Opracowanie zostało przygotowane przez przedstawicieli wszystkich specjalności medycznych zaangażowanych w postępowaniu u chorych na raka wątrobowokomórkowego

Wytyczne postępowania diagnostyczno-terapeutycznego w raku wątrobowokomórkowym

Rak wątrobowokomórkowy jest najczęstszym pierwotnym nowotworem wątroby. Częstość występowania raka wątrobowokomórkowego zwiększała się na świecie w ciągu ostatnich dekad. W Polsce rak wątrobowo komórkowy jest rozpoznawany u około 1500 chorych rocznie. Rokowanie chorych na raka wątrobowokomórkowego jest nadal niezadowalające. Chorobie można zapobiegać w znacznym stopniu przez skuteczniejszą kontrolę czynników ryzyka oraz nadzór nad osobami z marskością wątroby. Właściwe postępowanie diagnostyczne i terapeutyczne może poprawić rokowanie chorych na raka wątrobowokomórkowego. Przedstawiamy aktualizowaną wersję wytycznych postępowania u osob z czynnikami ryzyka oraz rozpoznaniem raka wątrobowokomórkowego. Opracowanie zostało przygotowane przez przedstawicieli wszystkich specjalności medycznych zaangażowanych w postępowaniu u chorych na raka wątrobowokomórkowego